Прямых запретов нет, всё сводится к тому является ли преобразование сделкой по обмену акций на доли в ООО. ФСФР считает, что является. ВАС эту позицию поддерживает http://open.lexpro.ru/document/3211715#11 Налоговая пока в стороне и регистрирует в любом случае.
Дело в том, что это старое ЗАО. Акционеров много, но большая часть либо исчезла, либо умерло. Претендовать никто ни на что точно не будет. Ценность его в том, что на нём висит хороший договор на помещение с городом. Юристы посоветовали перерегистрировать его в ООО и начать историю с чистого лица.